El ADN Mitocondrial es otro tipo de ADN encontrado en humanos, heredado de la madre, sin ninguna contribución del padre. Como resultado, se comporta de manera similar al Cromosoma Y pero para seguir los linajes maternos. Sin embargo, a diferencia de las pruebas del cromosoma Y, el ADN mitocondrial se transmite de la madre a todos sus hijos – hombres y mujeres.